В данной статье рассматриваются вопросы отражения финансовых активов и финансовых обязательств в бухгалтерском учёте в высших образовательных учреждениях. На основе требований Бюджетного стандарта бухгалтерского учёта №2 Республики Узбекистан проанализирован действующий порядок учёта поступлений по оплате за обучение на контрактной основе, расчётов со студентами, дебиторской и кредиторской задолженности, а также обязательств. В процессе исследования выявлены практические проблемы, связанные с финансовыми потерями из-за банковских комиссионных платежей в высших образовательных учреждениях, а также несоответствия данных в системах биллинга и UzASBO. В целях устранения указанных проблем разработаны предложения по совершенствованию механизма покрытия банковских комиссий, созданию единой платёжной платформы, интеграции информационных систем, а также усилению системы внутреннего контроля и аудита.